Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPTBN1Q01082 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SPTBN1Q01082 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.6 ms