Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXC5Q00444 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HOXC5Q00444 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms