Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2IP78347 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms