Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTA1P68133 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTA1P68133 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTA1P68133 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTA1P68133 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTA1P68133 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTA1P68133 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTA1P68133 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTA1P68133 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTA1P68133 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTA1P68133 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTA1P68133 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTA1P68133 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTA1P68133 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms