Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
EEF1A1P68104 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF1A1P68104 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms