Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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RAB5BP61020 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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RAB5BP61020 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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RAB5BP61020 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RAB5BP61020 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RAB5BP61020 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RAB5BP61020 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RAB5BP61020 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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