Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MCCD1P59942 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCCD1P59942 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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