Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF143P52747 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF143P52747 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF143P52747 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF143P52747 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF143P52747 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF143P52747 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF143P52747 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF143P52747 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF143P52747 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF143P52747 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF143P52747 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF143P52747 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF143P52747 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF143P52747 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF143P52747 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF143P52747 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF143P52747 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF143P52747 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF143P52747 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF143P52747 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF143P52747 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF143P52747 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF143P52747 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF143P52747 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF143P52747 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms