Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF138P52744 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF138P52744 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms