Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POU3F4P49335 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POU3F4P49335 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms