Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF9P41273 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFSF9P41273 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms