Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP6V1E1P36543 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms