Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASQ1P31415 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
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