Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB2P29033 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB2P29033 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB2P29033 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB2P29033 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB2P29033 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB2P29033 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB2P29033 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB2P29033 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB2P29033 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB2P29033 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB2P29033 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB2P29033 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB2P29033 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB2P29033 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB2P29033 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB2P29033 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB2P29033 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB2P29033 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB2P29033 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB2P29033 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB2P29033 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB2P29033 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB2P29033 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB2P29033 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB2P29033 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB2P29033 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB2P29033 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB2P29033 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB2P29033 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB2P29033 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB2P29033 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB2P29033 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB2P29033 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB2P29033 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB2P29033 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB2P29033 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB2P29033 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB2P29033 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB2P29033 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB2P29033 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB2P29033 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB2P29033 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB2P29033 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB2P29033 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB2P29033 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB2P29033 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB2P29033 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB2P29033 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB2P29033 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB2P29033 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB2P29033 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB2P29033 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB2P29033 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB2P29033 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB2P29033 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB2P29033 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB2P29033 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB2P29033 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB2P29033 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB2P29033 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB2P29033 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB2P29033 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB2P29033 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB2P29033 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB2P29033 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB2P29033 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB2P29033 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB2P29033 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB2P29033 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB2P29033 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB2P29033 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB2P29033 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB2P29033 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB2P29033 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB2P29033 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB2P29033 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB2P29033 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB2P29033 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB2P29033 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB2P29033 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB2P29033 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB2P29033 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB2P29033 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB2P29033 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB2P29033 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB2P29033 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB2P29033 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB2P29033 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB2P29033 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB2P29033 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB2P29033 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB2P29033 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GJB2P29033 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GJB2P29033 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GJB2P29033 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB2P29033 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB2P29033 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB2P29033 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJB2P29033 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms