Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TNFSF4P23510 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF4P23510 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms