Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BGNP21810 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BGNP21810 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BGNP21810 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BGNP21810 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BGNP21810 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BGNP21810 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BGNP21810 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BGNP21810 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BGNP21810 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BGNP21810 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BGNP21810 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BGNP21810 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BGNP21810 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BGNP21810 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BGNP21810 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BGNP21810 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BGNP21810 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BGNP21810 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BGNP21810 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BGNP21810 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BGNP21810 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BGNP21810 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BGNP21810 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BGNP21810 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BGNP21810 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BGNP21810 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BGNP21810 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BGNP21810 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BGNP21810 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BGNP21810 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BGNP21810 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BGNP21810 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BGNP21810 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BGNP21810 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BGNP21810 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BGNP21810 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BGNP21810 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BGNP21810 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BGNP21810 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BGNP21810 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BGNP21810 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BGNP21810 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BGNP21810 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BGNP21810 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BGNP21810 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BGNP21810 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BGNP21810 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BGNP21810 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BGNP21810 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BGNP21810 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BGNP21810 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BGNP21810 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BGNP21810 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BGNP21810 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BGNP21810 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BGNP21810 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BGNP21810 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BGNP21810 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BGNP21810 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BGNP21810 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BGNP21810 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BGNP21810 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BGNP21810 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BGNP21810 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BGNP21810 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BGNP21810 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BGNP21810 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BGNP21810 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BGNP21810 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BGNP21810 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BGNP21810 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BGNP21810 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BGNP21810 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BGNP21810 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BGNP21810 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BGNP21810 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BGNP21810 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BGNP21810 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BGNP21810 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BGNP21810 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BGNP21810 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BGNP21810 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BGNP21810 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BGNP21810 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BGNP21810 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BGNP21810 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BGNP21810 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BGNP21810 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BGNP21810 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BGNP21810 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BGNP21810 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BGNP21810 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BGNP21810 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BGNP21810 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BGNP21810 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BGNP21810 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BGNP21810 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BGNP21810 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BGNP21810 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms