Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ERCC3P19447 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ERCC3P19447 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms