Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PYGBP11216 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PYGBP11216 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PYGBP11216 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PYGBP11216 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PYGBP11216 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PYGBP11216 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PYGBP11216 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PYGBP11216 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PYGBP11216 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PYGBP11216 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PYGBP11216 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PYGBP11216 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PYGBP11216 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PYGBP11216 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PYGBP11216 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PYGBP11216 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PYGBP11216 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PYGBP11216 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PYGBP11216 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PYGBP11216 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PYGBP11216 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PYGBP11216 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PYGBP11216 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PYGBP11216 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PYGBP11216 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PYGBP11216 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PYGBP11216 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PYGBP11216 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PYGBP11216 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PYGBP11216 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PYGBP11216 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PYGBP11216 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PYGBP11216 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PYGBP11216 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PYGBP11216 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PYGBP11216 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PYGBP11216 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PYGBP11216 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PYGBP11216 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PYGBP11216 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PYGBP11216 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PYGBP11216 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PYGBP11216 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PYGBP11216 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PYGBP11216 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PYGBP11216 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PYGBP11216 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PYGBP11216 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PYGBP11216 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PYGBP11216 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PYGBP11216 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PYGBP11216 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PYGBP11216 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PYGBP11216 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PYGBP11216 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PYGBP11216 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PYGBP11216 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PYGBP11216 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PYGBP11216 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PYGBP11216 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PYGBP11216 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PYGBP11216 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PYGBP11216 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PYGBP11216 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PYGBP11216 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PYGBP11216 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PYGBP11216 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PYGBP11216 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PYGBP11216 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PYGBP11216 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PYGBP11216 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PYGBP11216 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PYGBP11216 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PYGBP11216 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PYGBP11216 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PYGBP11216 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PYGBP11216 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PYGBP11216 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PYGBP11216 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PYGBP11216 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PYGBP11216 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PYGBP11216 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PYGBP11216 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PYGBP11216 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PYGBP11216 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PYGBP11216 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PYGBP11216 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PYGBP11216 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PYGBP11216 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PYGBP11216 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PYGBP11216 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PYGBP11216 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PYGBP11216 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PYGBP11216 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PYGBP11216 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PYGBP11216 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PYGBP11216 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PYGBP11216 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PYGBP11216 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms