Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GLI3P10071 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GLI3P10071 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GLI3P10071 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GLI3P10071 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GLI3P10071 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GLI3P10071 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GLI3P10071 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GLI3P10071 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GLI3P10071 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GLI3P10071 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GLI3P10071 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GLI3P10071 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GLI3P10071 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GLI3P10071 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GLI3P10071 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GLI3P10071 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GLI3P10071 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GLI3P10071 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GLI3P10071 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GLI3P10071 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GLI3P10071 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GLI3P10071 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GLI3P10071 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GLI3P10071 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GLI3P10071 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GLI3P10071 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GLI3P10071 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GLI3P10071 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI3P10071 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI3P10071 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI3P10071 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI3P10071 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI3P10071 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI3P10071 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI3P10071 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI3P10071 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI3P10071 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI3P10071 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI3P10071 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI3P10071 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI3P10071 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI3P10071 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GLI3P10071 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI3P10071 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI3P10071 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI3P10071 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI3P10071 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI3P10071 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI3P10071 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI3P10071 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI3P10071 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI3P10071 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI3P10071 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI3P10071 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI3P10071 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI3P10071 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI3P10071 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI3P10071 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI3P10071 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI3P10071 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI3P10071 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI3P10071 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GLI3P10071 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GLI3P10071 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GLI3P10071 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GLI3P10071 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GLI3P10071 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GLI3P10071 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GLI3P10071 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GLI3P10071 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
GLI3P10071 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GLI3P10071 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GLI3P10071 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GLI3P10071 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GLI3P10071 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GLI3P10071 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GLI3P10071 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GLI3P10071 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GLI3P10071 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GLI3P10071 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GLI3P10071 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GLI3P10071 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GLI3P10071 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GLI3P10071 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GLI3P10071 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GLI3P10071 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GLI3P10071 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GLI3P10071 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GLI3P10071 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GLI3P10071 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GLI3P10071 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GLI3P10071 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GLI3P10071 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GLI3P10071 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GLI3P10071 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GLI3P10071 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GLI3P10071 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GLI3P10071 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GLI3P10071 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms