Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf88P0DMB2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms