Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms