Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM3P06753 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM3P06753 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM3P06753 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM3P06753 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM3P06753 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM3P06753 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM3P06753 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM3P06753 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM3P06753 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM3P06753 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM3P06753 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM3P06753 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM3P06753 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM3P06753 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM3P06753 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM3P06753 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM3P06753 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM3P06753 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM3P06753 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM3P06753 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM3P06753 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM3P06753 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM3P06753 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM3P06753 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM3P06753 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TPM3P06753 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM3P06753 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM3P06753 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM3P06753 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM3P06753 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM3P06753 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM3P06753 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM3P06753 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM3P06753 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM3P06753 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM3P06753 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM3P06753 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM3P06753 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM3P06753 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM3P06753 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM3P06753 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM3P06753 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM3P06753 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM3P06753 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM3P06753 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM3P06753 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM3P06753 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM3P06753 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM3P06753 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM3P06753 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM3P06753 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM3P06753 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM3P06753 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM3P06753 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM3P06753 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM3P06753 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM3P06753 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM3P06753 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM3P06753 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM3P06753 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM3P06753 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM3P06753 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM3P06753 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM3P06753 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM3P06753 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM3P06753 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM3P06753 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM3P06753 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM3P06753 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM3P06753 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM3P06753 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM3P06753 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM3P06753 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM3P06753 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM3P06753 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM3P06753 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM3P06753 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM3P06753 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM3P06753 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM3P06753 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM3P06753 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM3P06753 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM3P06753 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM3P06753 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM3P06753 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM3P06753 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM3P06753 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM3P06753 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM3P06753 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM3P06753 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM3P06753 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM3P06753 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM3P06753 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM3P06753 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM3P06753 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM3P06753 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM3P06753 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM3P06753 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM3P06753 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms