Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOC3P02656 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC3P02656 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC3P02656 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC3P02656 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC3P02656 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC3P02656 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC3P02656 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC3P02656 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC3P02656 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC3P02656 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC3P02656 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC3P02656 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC3P02656 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC3P02656 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC3P02656 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC3P02656 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC3P02656 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC3P02656 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC3P02656 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC3P02656 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC3P02656 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC3P02656 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC3P02656 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC3P02656 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC3P02656 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC3P02656 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC3P02656 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC3P02656 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC3P02656 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOC3P02656 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC3P02656 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC3P02656 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC3P02656 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC3P02656 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC3P02656 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC3P02656 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC3P02656 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC3P02656 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC3P02656 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC3P02656 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC3P02656 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC3P02656 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC3P02656 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC3P02656 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC3P02656 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC3P02656 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC3P02656 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC3P02656 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC3P02656 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC3P02656 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC3P02656 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC3P02656 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC3P02656 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC3P02656 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOC3P02656 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC3P02656 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC3P02656 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC3P02656 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC3P02656 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC3P02656 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC3P02656 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC3P02656 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC3P02656 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC3P02656 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC3P02656 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC3P02656 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC3P02656 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC3P02656 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC3P02656 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC3P02656 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC3P02656 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC3P02656 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC3P02656 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC3P02656 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC3P02656 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC3P02656 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC3P02656 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC3P02656 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC3P02656 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC3P02656 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
APOC3P02656 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC3P02656 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC3P02656 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC3P02656 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC3P02656 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC3P02656 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC3P02656 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC3P02656 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC3P02656 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC3P02656 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC3P02656 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC3P02656 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC3P02656 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC3P02656 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC3P02656 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC3P02656 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC3P02656 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC3P02656 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
APOC3P02656 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms