Protein–RNA interactions for Protein: P00558

PGK1, Phosphoglycerate kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGK1P00558 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGK1P00558 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGK1P00558 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGK1P00558 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGK1P00558 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGK1P00558 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGK1P00558 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGK1P00558 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGK1P00558 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PGK1P00558 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGK1P00558 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGK1P00558 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGK1P00558 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGK1P00558 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGK1P00558 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGK1P00558 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGK1P00558 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGK1P00558 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGK1P00558 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGK1P00558 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGK1P00558 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGK1P00558 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGK1P00558 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGK1P00558 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGK1P00558 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGK1P00558 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGK1P00558 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGK1P00558 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGK1P00558 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGK1P00558 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGK1P00558 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGK1P00558 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGK1P00558 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGK1P00558 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGK1P00558 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGK1P00558 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGK1P00558 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGK1P00558 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGK1P00558 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGK1P00558 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGK1P00558 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGK1P00558 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGK1P00558 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGK1P00558 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGK1P00558 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGK1P00558 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGK1P00558 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGK1P00558 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGK1P00558 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGK1P00558 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGK1P00558 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGK1P00558 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PGK1P00558 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PGK1P00558 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGK1P00558 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGK1P00558 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGK1P00558 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGK1P00558 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGK1P00558 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGK1P00558 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PGK1P00558 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGK1P00558 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGK1P00558 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGK1P00558 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PGK1P00558 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGK1P00558 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGK1P00558 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGK1P00558 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGK1P00558 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PGK1P00558 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
PGK1P00558 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGK1P00558 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGK1P00558 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGK1P00558 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGK1P00558 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGK1P00558 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGK1P00558 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGK1P00558 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGK1P00558 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGK1P00558 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGK1P00558 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGK1P00558 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGK1P00558 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK1P00558 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK1P00558 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK1P00558 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK1P00558 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK1P00558 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK1P00558 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK1P00558 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK1P00558 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK1P00558 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK1P00558 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK1P00558 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK1P00558 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK1P00558 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK1P00558 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK1P00558 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK1P00558 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK1P00558 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms