Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DHX16O60231 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DHX16O60231 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DHX16O60231 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DHX16O60231 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DHX16O60231 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DHX16O60231 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DHX16O60231 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DHX16O60231 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DHX16O60231 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DHX16O60231 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DHX16O60231 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DHX16O60231 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DHX16O60231 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DHX16O60231 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DHX16O60231 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DHX16O60231 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DHX16O60231 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DHX16O60231 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DHX16O60231 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
DHX16O60231 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DHX16O60231 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DHX16O60231 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DHX16O60231 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DHX16O60231 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DHX16O60231 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DHX16O60231 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DHX16O60231 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DHX16O60231 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DHX16O60231 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DHX16O60231 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DHX16O60231 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DHX16O60231 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DHX16O60231 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DHX16O60231 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DHX16O60231 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DHX16O60231 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DHX16O60231 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DHX16O60231 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DHX16O60231 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DHX16O60231 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DHX16O60231 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DHX16O60231 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DHX16O60231 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DHX16O60231 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DHX16O60231 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DHX16O60231 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DHX16O60231 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DHX16O60231 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DHX16O60231 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DHX16O60231 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX16O60231 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX16O60231 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX16O60231 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX16O60231 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX16O60231 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX16O60231 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX16O60231 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX16O60231 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX16O60231 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX16O60231 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX16O60231 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX16O60231 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX16O60231 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX16O60231 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX16O60231 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX16O60231 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX16O60231 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX16O60231 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX16O60231 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX16O60231 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DHX16O60231 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DHX16O60231 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DHX16O60231 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DHX16O60231 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DHX16O60231 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DHX16O60231 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DHX16O60231 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DHX16O60231 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DHX16O60231 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DHX16O60231 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DHX16O60231 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DHX16O60231 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DHX16O60231 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DHX16O60231 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DHX16O60231 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DHX16O60231 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DHX16O60231 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DHX16O60231 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DHX16O60231 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DHX16O60231 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DHX16O60231 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DHX16O60231 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DHX16O60231 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DHX16O60231 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DHX16O60231 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DHX16O60231 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DHX16O60231 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DHX16O60231 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DHX16O60231 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms