Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COCHO43405 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COCHO43405 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COCHO43405 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COCHO43405 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COCHO43405 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COCHO43405 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COCHO43405 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COCHO43405 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COCHO43405 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COCHO43405 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COCHO43405 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COCHO43405 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COCHO43405 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COCHO43405 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COCHO43405 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COCHO43405 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COCHO43405 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COCHO43405 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COCHO43405 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COCHO43405 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COCHO43405 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COCHO43405 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COCHO43405 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COCHO43405 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COCHO43405 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COCHO43405 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COCHO43405 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COCHO43405 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COCHO43405 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COCHO43405 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COCHO43405 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COCHO43405 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COCHO43405 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COCHO43405 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COCHO43405 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COCHO43405 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COCHO43405 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COCHO43405 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COCHO43405 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COCHO43405 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COCHO43405 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COCHO43405 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COCHO43405 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COCHO43405 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COCHO43405 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COCHO43405 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COCHO43405 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COCHO43405 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COCHO43405 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COCHO43405 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COCHO43405 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COCHO43405 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COCHO43405 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COCHO43405 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COCHO43405 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COCHO43405 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COCHO43405 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COCHO43405 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
COCHO43405 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COCHO43405 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
COCHO43405 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COCHO43405 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COCHO43405 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COCHO43405 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COCHO43405 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COCHO43405 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COCHO43405 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COCHO43405 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COCHO43405 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COCHO43405 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COCHO43405 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COCHO43405 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COCHO43405 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COCHO43405 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COCHO43405 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
COCHO43405 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
COCHO43405 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COCHO43405 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COCHO43405 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COCHO43405 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
COCHO43405 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COCHO43405 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COCHO43405 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COCHO43405 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COCHO43405 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COCHO43405 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COCHO43405 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COCHO43405 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COCHO43405 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COCHO43405 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COCHO43405 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COCHO43405 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COCHO43405 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COCHO43405 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COCHO43405 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COCHO43405 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COCHO43405 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COCHO43405 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COCHO43405 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms