Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EBAG9O00559 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EBAG9O00559 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms