Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF879B4DU55 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms