Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf170A2RU37 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms