Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPDC1A2A3K4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPDC1A2A3K4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms