Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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