Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A3GALT2U3KPV4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
A3GALT2U3KPV4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms