Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPN6Q9Y6Q1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPN6Q9Y6Q1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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