Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNMT3LQ9UJW3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNMT3LQ9UJW3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNMT3LQ9UJW3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNMT3LQ9UJW3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNMT3LQ9UJW3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNMT3LQ9UJW3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DNMT3LQ9UJW3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms