Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIMS3Q9UJD0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms