Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNA3Q9UI47 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNA3Q9UI47 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms