Protein–RNA interactions for Protein: Q9P021

CRIPT, Cysteine-rich PDZ-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIPTQ9P021 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
CRIPTQ9P021 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms