Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD2Q9NZR1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD2Q9NZR1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD2Q9NZR1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD2Q9NZR1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD2Q9NZR1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD2Q9NZR1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD2Q9NZR1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMOD2Q9NZR1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMOD2Q9NZR1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms