Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC10Q9NYD6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
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