Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATAD3AQ9NVI7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATAD3AQ9NVI7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATAD3AQ9NVI7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATAD3AQ9NVI7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATAD3AQ9NVI7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms