Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.05■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AP5S1Q9NUS5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP5S1Q9NUS5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms