Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC39A9Q9NUM3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC39A9Q9NUM3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms