Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
C8orf4Q9NR00 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C8orf4Q9NR00 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms