Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.023e-15■■■■■ 230.7
UTP3Q9NQZ2 EEF1AKMT2-206ENST00000498770 787 ntTSL 57.82□□□□□ -1.163e-15■■■■■ 230.7
UTP3Q9NQZ2 TTC37-207ENST00000507805 1321 ntTSL 56.76□□□□□ -1.333e-15■■■■■ 230.7
UTP3Q9NQZ2 EGF-205ENST00000504633 584 ntTSL 36.38□□□□□ -1.393e-15■■■■■ 230.7
UTP3Q9NQZ2 PCBD2-203ENST00000510013 361 ntTSL 55.65□□□□□ -1.53e-15■■■■■ 230.7
UTP3Q9NQZ2 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.63e-15■■■■■ 230.7
UTP3Q9NQZ2 RFWD2-206ENST00000461830 2131 ntTSL 57.76□□□□□ -1.172e-7■■■■■ 230.7
UTP3Q9NQZ2 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 230.6
UTP3Q9NQZ2 NAPA-206ENST00000594155 416 ntTSL 58.57□□□□□ -1.044e-10■■■■■ 230.5
UTP3Q9NQZ2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.536e-7■■■■■ 229.9
UTP3Q9NQZ2 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.196e-7■■■■■ 229.9
UTP3Q9NQZ2 SPIDR-214ENST00000521550 1849 ntTSL 215.03■□□□□ -06e-7■■■■■ 229.9
UTP3Q9NQZ2 SPIDR-217ENST00000522117 2745 ntTSL 213.77□□□□□ -0.216e-7■■■■■ 229.9
UTP3Q9NQZ2 SPIDR-206ENST00000518074 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.456e-7■■■■■ 229.9
UTP3Q9NQZ2 SPIDR-225ENST00000524141 2761 ntTSL 210.85□□□□□ -0.676e-7■■■■■ 229.9
UTP3Q9NQZ2 SPIDR-224ENST00000524126 2614 ntTSL 1 (best)10.8□□□□□ -0.686e-7■■■■■ 229.9
UTP3Q9NQZ2 UBE2H-207ENST00000486283 788 ntTSL 38.51□□□□□ -1.052e-8■■■■■ 229.9
UTP3Q9NQZ2 FCHSD1-206ENST00000522126 2577 ntTSL 217.99■□□□□ 0.473e-9■■■■■ 229.8
UTP3Q9NQZ2 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.013e-9■■■■■ 229.8
UTP3Q9NQZ2 FCHSD1-201ENST00000435817 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.183e-9■■■■■ 229.8
UTP3Q9NQZ2 FCHSD1-210ENST00000523856 3932 ntTSL 213.2□□□□□ -0.33e-9■■■■■ 229.8
UTP3Q9NQZ2 PHKB-207ENST00000566037 1032 ntTSL 224.7■■□□□ 1.543e-7■■■■■ 229.7
UTP3Q9NQZ2 PHKB-206ENST00000565424 828 ntTSL 37.97□□□□□ -1.133e-7■■■■■ 229.7
UTP3Q9NQZ2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 229.7
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC9-210ENST00000521667 2021 ntTSL 1 (best)19.96■□□□□ 0.796e-7■■■■■ 229.7
UTP3Q9NQZ2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.151e-6■■■■■ 229.7
UTP3Q9NQZ2 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.071e-6■■■■■ 229.7
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP11B-206ENST00000566548 484 ntTSL 312.29□□□□□ -0.448e-7■■■■■ 229.6
UTP3Q9NQZ2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.984e-8■■■■■ 229.4
UTP3Q9NQZ2 MCM2-207ENST00000477668 2510 ntTSL 220.79■□□□□ 0.921e-6■■■■■ 229.4
UTP3Q9NQZ2 MCM2-206ENST00000474964 2847 ntTSL 217.87■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 229.4
UTP3Q9NQZ2 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.034e-8■■■■■ 229.4
UTP3Q9NQZ2 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 229.4
UTP3Q9NQZ2 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.064e-8■■■■■ 229.4
UTP3Q9NQZ2 PHKB-214ENST00000567402 1617 ntTSL 1 (best)11.35□□□□□ -0.593e-7■■■■■ 229.3
UTP3Q9NQZ2 UIMC1-212ENST00000511320 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 229.2
UTP3Q9NQZ2 UIMC1-213ENST00000512031 2467 ntTSL 58.87□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 229.2
UTP3Q9NQZ2 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 229.2
UTP3Q9NQZ2 ABL1-203ENST00000393293 532 ntTSL 59.62□□□□□ -0.875e-9■■■■■ 229.1
UTP3Q9NQZ2 PTK2-257ENST00000524357 535 ntTSL 422.21■■□□□ 1.152e-6■■■■■ 228.8
UTP3Q9NQZ2 NUMBL-206ENST00000598773 834 ntTSL 523.44■■□□□ 1.348e-7■■■■■ 228.8
UTP3Q9NQZ2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.788e-7■■■■■ 228.8
UTP3Q9NQZ2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.768e-7■■■■■ 228.8
UTP3Q9NQZ2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.368e-7■■■■■ 228.8
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC9-214ENST00000523777 705 ntTSL 317.2■□□□□ 0.345e-7■■■■■ 228.6
UTP3Q9NQZ2 RNF213-205ENST00000558116 3768 ntTSL 29.48□□□□□ -0.893e-22■■■■■ 228.6
UTP3Q9NQZ2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.775e-7■■■■■ 228.4
UTP3Q9NQZ2 IVNS1ABP-204ENST00000459929 3657 ntTSL 514.42□□□□□ -0.15e-7■■■■■ 228.4
UTP3Q9NQZ2 RCOR3-205ENST00000472734 452 ntTSL 222.85■■□□□ 1.253e-9■■■■■ 228.2
UTP3Q9NQZ2 RCOR3-210ENST00000528408 570 ntTSL 217.43■□□□□ 0.383e-9■■■■■ 228.2
UTP3Q9NQZ2 DLST-202ENST00000334220 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.451e-13■■■■■ 228.1
UTP3Q9NQZ2 DLST-210ENST00000555492 569 ntTSL 312.16□□□□□ -0.461e-13■■■■■ 228.1
UTP3Q9NQZ2 DLST-201ENST00000238671 1464 ntTSL 211.76□□□□□ -0.531e-13■■■■■ 228.1
UTP3Q9NQZ2 DLST-215ENST00000557012 698 ntTSL 211.48□□□□□ -0.571e-13■■■■■ 228.1
UTP3Q9NQZ2 DLST-206ENST00000555071 1365 ntTSL 211.07□□□□□ -0.641e-13■■■■■ 228.1
UTP3Q9NQZ2 DLST-214ENST00000556582 568 ntTSL 310.49□□□□□ -0.731e-13■■■■■ 228.1
UTP3Q9NQZ2 DLST-208ENST00000555190 803 ntTSL 410.38□□□□□ -0.751e-13■■■■■ 228.1
UTP3Q9NQZ2 DLST-209ENST00000555459 567 ntTSL 410.38□□□□□ -0.751e-13■■■■■ 228.1
UTP3Q9NQZ2 DLST-204ENST00000554612 1479 ntTSL 210.23□□□□□ -0.771e-13■■■■■ 228.1
UTP3Q9NQZ2 DLST-207ENST00000555089 1078 ntTSL 1 (best)9.83□□□□□ -0.841e-13■■■■■ 228.1
UTP3Q9NQZ2 DLST-213ENST00000556460 563 ntTSL 39.27□□□□□ -0.931e-13■■■■■ 228.1
UTP3Q9NQZ2 DLST-205ENST00000554806 837 ntTSL 1 (best)9.18□□□□□ -0.941e-13■■■■■ 228.1
UTP3Q9NQZ2 DLST-216ENST00000626051 252 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.141e-13■■■■■ 228.1
UTP3Q9NQZ2 ACAP2-205ENST00000447662 700 ntTSL 518.19■□□□□ 0.51e-10■■■■■ 227.8
UTP3Q9NQZ2 ACAP2-203ENST00000439666 235 ntTSL 35.09□□□□□ -1.591e-10■■■■■ 227.8
UTP3Q9NQZ2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.472e-8■■■■■ 227.8
UTP3Q9NQZ2 ABCA2-221ENST00000492260 2062 ntTSL 520.47■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 227.6
UTP3Q9NQZ2 TCF7L2-223ENST00000629706 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 227.3
UTP3Q9NQZ2 ICAM1-201ENST00000264832 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.579e-7■■■■■ 227.3
UTP3Q9NQZ2 TCF7L2-204ENST00000352065 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 227.3
UTP3Q9NQZ2 TCF7L2-205ENST00000355717 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 227.3
UTP3Q9NQZ2 TCF7L2-221ENST00000545257 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.881e-6■■■■■ 227.3
UTP3Q9NQZ2 TCF7L2-216ENST00000534894 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.941e-6■■■■■ 227.3
UTP3Q9NQZ2 TCF7L2-209ENST00000369395 1541 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.031e-6■■■■■ 227.3
UTP3Q9NQZ2 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 227.3
UTP3Q9NQZ2 TCF7L2-202ENST00000346198 667 ntTSL 37.2□□□□□ -1.261e-6■■■■■ 227.3
UTP3Q9NQZ2 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.291e-6■■■■■ 227.3
UTP3Q9NQZ2 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.291e-6■■■■■ 227.3
UTP3Q9NQZ2 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 227.3
UTP3Q9NQZ2 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.321e-6■■■■■ 227.3
UTP3Q9NQZ2 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.341e-6■■■■■ 227.3
UTP3Q9NQZ2 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.41e-6■■■■■ 227.3
UTP3Q9NQZ2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.153e-6■■■■■ 227.2
UTP3Q9NQZ2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.283e-6■■■■■ 227.2
UTP3Q9NQZ2 TGFBR1-204ENST00000547314 533 ntTSL 48.22□□□□□ -1.092e-9■■■■■ 227.2
UTP3Q9NQZ2 TGFBR1-210ENST00000552573 526 ntTSL 44.18□□□□□ -1.742e-9■■■■■ 227.2
UTP3Q9NQZ2 ADARB1-208ENST00000462214 587 ntTSL 38.71□□□□□ -1.024e-7■■■■■ 227.2
UTP3Q9NQZ2 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.231e-9■■■■■ 227.2
UTP3Q9NQZ2 TEX101-203ENST00000602198 1446 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.421e-9■■■■■ 227.2
UTP3Q9NQZ2 POLR2F-206ENST00000443002 1890 ntTSL 223.69■■□□□ 1.381e-8■■■■■ 227.1
UTP3Q9NQZ2 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.141e-8■■■■■ 227.1
UTP3Q9NQZ2 PCYT2-207ENST00000571581 999 ntTSL 527.25■■□□□ 1.956e-7■■■■■ 227.1
UTP3Q9NQZ2 PCYT2-213ENST00000573401 1028 ntTSL 526.24■■□□□ 1.796e-7■■■■■ 227.1
UTP3Q9NQZ2 PCYT2-214ENST00000573636 913 ntTSL 525.18■■□□□ 1.626e-7■■■■■ 227.1
UTP3Q9NQZ2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 226.9
UTP3Q9NQZ2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 226.9
UTP3Q9NQZ2 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 226.9
UTP3Q9NQZ2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.211e-8■■■■■ 226.9
UTP3Q9NQZ2 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.21e-8■■■■■ 226.9
UTP3Q9NQZ2 PRKN-207ENST00000479615 904 ntTSL 515.88■□□□□ 0.131e-8■■■■■ 226.9
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