Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA4BQ9NPR2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms