Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLIRPQ9GZT3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLIRPQ9GZT3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms