Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RSG1Q9BU20 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 392.4 ms