Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RHOXF2Q9BQY4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms