Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5SQ99766 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5SQ99766 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5SQ99766 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5SQ99766 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5SQ99766 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5SQ99766 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5SQ99766 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5SQ99766 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5SQ99766 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5SQ99766 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5SQ99766 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5SQ99766 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5SQ99766 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5SQ99766 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5SQ99766 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5SQ99766 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5SQ99766 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5SQ99766 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5SQ99766 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5SQ99766 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5SQ99766 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5SQ99766 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5SQ99766 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5SQ99766 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5SQ99766 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5SQ99766 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5SQ99766 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5SQ99766 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP5SQ99766 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms