Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNF2Q99496 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms